Новая модель сбора биопрепаратов высокого качества для геномного анализа

Новая модель сбора биопрепаратов высокого качества для геномного анализа

Успешное пилотное исследование продемонстрировало осуществимость нового подхода к сбору образцов здоровой посмертной крови и тканей от сотен доноров для использования в анализе экспрессии генов. Эта новая платформа для сбора биопрепаратов, основанная на партнерстве с организациями, занимающимися оперативной аутопсией и закупкой органов, может служить моделью для других будущих исследовательских проектов, как описано в разделе «Биоконсервация и биобанкинг».

Латарша Каритерс и соавторы из Национального института рака, Национальных институтов здравоохранения (NIH, Bethesda, MD), Leidos Biomedical Research, Inc. (Фредерик, доктор медицины) и Институт Броада Массачусетского технологического института и Гарварда (Кембридж, Массачусетс) описывают цели, методологию, проблемы и извлеченные уроки сбора биологических образцов в статье, озаглавленной, “Новый подход к получению высококачественных посмертных тканей: проект GTEx”. Эта статья дополняет серию рукописей, опубликованных ранее в этом году в журналах Science и других журналах, которые описывают первоначальные молекулярные результаты пилотного исследования Genotype-Tissue Expression (GTEx).

Проект GTEx, спонсируемый Общим фондом NIH, анализирует экспрессию генов в нормальных, здоровых тканях человека, чтобы понять влияние генетической изменчивости. Участвующие исследователи разработали методы и инфраструктуру для сбора, характеристики и распределения образцов тканей и клеточных линий от здоровых доноров для анализа в рамках проекта GTEx. Теперь исследователи могут запрашивать доступ к данным и биопрепаратам из этого ценного ресурса GTEx через портал GTEx. Доступны ткани из 45 различных участков ткани от более чем 900 доноров с соответствующими клиническими, демографическими, манипуляционными и патологическими данными. Кроме того, в настоящее время доступны данные всего экзома и всего генома от 450 доноров, а также данные секвенирования РНК примерно из 9000 тканей, при этом запланированы будущие выпуски данных, чтобы сделать генетические данные от всех доноров GTEx доступными.

“Проект GTEx – это крупное исследование Национального института здравоохранения, которое предоставит ценные ресурсы исследователям, стремящимся понять процессы заболевания и разработать методы лечения,” говорит главный редактор Джим Вотут, доктор философии. “Мы рады, что авторы решили отправить этот важный документ, посвященный уникальному подходу проекта к сбору и обработке биологических образцов, в Biopreservation и Biobanking.”

Исследование, представленное в этой публикации, было поддержано Национальными институтами здравоохранения под номерами наград HHSN261200800001E, 10XS170, 10XS171, 10X172, 12ST1029, 10ST1035, HHSN268201000029C и R01 DA006227-17.

VIRTU-VIRUS.RU