Липиды с характеромЛипиды – часто просто названный жирами – являются сложными веществами, которые в дополнение к различным другим компонентам преимущественно состоят из жирных кислот. В исследовании липида, однако, есть все еще много неизвестных вещей.
Кроме того, обнаружение структурных свойств молекул липида в профилировании высокой пропускной способности находится все еще в его младенчестве. В представленной методике высокой пропускной способности большое количество образцов измерено, используя масс-спектрометрию.
Эти данные (т.е., спектры) предоставляют информацию для идентификации типа и класса липида или типа и положения жирных acyl цепей. Однако измеренные спектры могут отличаться между одними и теми же разновидностями липида, потому что липиды показывают различные фрагменты в спектрах в зависимости от установки массового спектрометра и ионизации. Из-за этого спектрального разнообразия, до сих пор не было никакого универсально применимого программного обеспечения биоинформатики для автоматизированного обнаружения структур липида.
Герхард Таллингер из Института Граца TU Вычислительной Биотехнологии объясняет необходимость автоматизированной характеристики липида: «Быстрые и надежные детали о составе липида образцов клетки – предпосылка для сравнений со справочными образцами от здоровых клеток – которые требуются для обнаружения особенности биомаркеров для болезней. Важный вопрос – какие изменения в составе липида клеток релевантны в диагностике?»«Данные о Липиде Анализатор», какие исследователи Граца TU, Медицинский Uni Грац и Университет Граца издали по своей природе Методы, облегчат работу чрезвычайно в биомедицинском исследовании и определенно ускорят исследование липида – этого Юргена Хартлера, также в Институте Вычислительной Биотехнологии, убежден: «Метод, который мы разработали в сотрудничестве с коллегами от Медицинского Uni Грац и Грац Uni, интерпретирует спектры липида, используя интуитивные наборы правила и может быть как таковым гибко приспособленный к различным особенностям фрагментации. Это позволяет впервые определить липиды на очень подробном структурном уровне более точно и достоверно, чем предыдущие решения».
Команда Граца TU была ответственна за разработку программного обеспечения, массовые спектральные эксперименты и тесты на удобство использования были выполнены в Центре Медицинского Исследования (ZMF) Грацского медицинского университета и Университета Граца, и биологические эксперименты были выполнены в Университете Граца.Растяжимый к другим метаболическим продуктам, таким как сахарВ представленном исследовании Данные о Липиде Анализатор обнаружил больше чем 100 новых разновидностей липида, о которых ранее не сообщили. Инструмент может быть гибко адаптирован – и не только для новых классов липидов.
Это может использоваться, например, чтобы характеризовать полисахариды и glycolipids, т.е. липиды с приложенным сахаром. Исследователи предоставляют их Данным о Липиде Анализатор как открытый источник научному сообществу.