Исследователи дебатировали, является ли эукариоты — группа относительно сложных организмов, включающая грибы, растения и животных — потомками archaea или просто их близкими родственниками. Недавно обнаруженные archaea от нижней части Североатлантического Океана предполагают что эукариоты, развитые из archaea.
Геномный анализ одного из организмов, названных Loki, показывает, что это – самый подобный эукариоту прокариот, до сих пор обнаруженный. Исследование предполагает, что у предка eukaroytes, возможно, были цитоскелет актина и элементарные внутренние структуры, составленные из мембран.