Ученые из Медицинского центра Университета Дьюка установили, что гены, действующие как молекулярные "вкл выкл" переключатели могут определять клинически значимые молекулярные подтипы рака яичников, обеспечивая идеальные потенциальные цели для использования в клинических прогностических и диагностических исследованиях. Эти бимодальные гены могут определять подтипы опухолей, которые имеют разные общие прогнозы и реагируют на разные терапевтические схемы. Результаты исследователей опубликованы в майском номере журнала «Молекулярная диагностика».
"Мы определили очень небольшой набор генов, которые потенциально могут быть надежными прогностическими маркерами эпителиального рака яичников," объясняет ведущий следователь Майкл Б. Датто, доктор медицинских наук. "Мы также продемонстрировали полезность нового подхода, открытия бимодальных генов, для определения клинически значимых мишеней экспрессии."
Карцинома яичников имеет самый высокий уровень смертности среди гинекологических злокачественных новообразований и является пятой по частоте причиной смерти от рака у женщин. Методы прогнозирования серозных карцином, наиболее распространенного типа эпителиальных злокачественных новообразований яичников, остаются относительно неточными. Большинство пациентов поступают с опухолями высокой степени злокачественности на поздних стадиях и имеют в целом плохой прогноз. Однако в этой группе есть подмножество с устойчивым ответом на химиотерапию, что приводит к лучшей выживаемости. В настоящее время нет общепринятых тестов, которые могли бы отличить опухоли, которые можно было бы более эффективно лечить.
Основываясь на ранних работах по раку груди, доктор. Датто и его коллеги предположили, что клинически значимые бимодальные гены существуют при эпителиальном раке яичников. Используя большой общедоступный набор данных микрочипов рака яичников, они применили ранее описанный алгоритм определения биомодального индекса для оценки экспрессии всех генов в 285 образцах. Они идентифицировали многие гены с устойчивыми паттернами бимодальной экспрессии. Они также обнаружили, что ряд генов с бимодальными паттернами экспрессии в значительной степени связаны с типом опухоли и / или общей выживаемостью пациента. При объединении в единую сумму баллов выживаемости главные гены, важные для выживаемости, идентифицируют клинически отличный молекулярный подтип злокачественной серозной карциномы яичников.
"С точки зрения клинического тестирования, гены с непрерывным паттерном экспрессии могут стать трудными мишенями для тестирования. Однако различие между «включенной» и «выключенной» экспрессией конкретного бимодального гена относительно несложно," говорит доктор. Датто. "Это позволяет четко определить границы принятия решений и разработать точные и надежные методы тестирования. Бимодальные гены также могут быть кандидатами для тестирования менее количественными методами, такими как иммуногистохимия."
Некоторые из бимодальных генов, которые идентифицировали исследователи, имеют известную роль в онкогенезе. "Это повышает вероятность того, что мы описали гены молекулярного переключателя, которые будут актуальны не только в контексте рака яичников, но и для множества типов опухолей," Доктор. Датто заключает.