Новое напряжение «свиного гриппа» H1N1, которое распространяется во всем мире и является почти на пандемическом аварийном уровне, имеет только половину ключевых генетических маркеровнайденный в предыдущих пандемических штаммах, сказали американские исследователи вчера.Джонатан Аллен и Том Слезэк от Ливерморской национальной лаборатории, американской лаборатории Министерства энергетики в Ливерморе, Калифорния, иколлеги, изданные исследование в журнале BMC Microbiology 2 открытого доступа несколько недель, назад описывающем, как они нашли 34 сохраненных аминопластакислотные маркеры от прошлых пандемических штаммов вируса гриппа.С тех пор они проанализировали последовательности от нового вируса H1N1 и нашли, что он имеет только половину этих 34 маркеров.
Однако Слезэк предостерег что, в то время как их обнаружение предполагает, что текущее напряжение H1N1 испытывает недостаток во многих признаках который сделанный предыдущими вспышкамисмертельно, отсутствие подобия тем штаммам не означает, что не будет основная проблема.Аллен и Слизэк также сказали, что больше исследования было необходимо, прежде чем мы сможем сказать, насколько опасный новое напряжение могло бы фактически быть.В их оригинальном исследовании Аллен и Слизэк и коллеги использовали принципы обратного проектирования, чтобы искать класс определенные мутации аминокислоты, сохраненные в прошломпандемии.
Чтобы сделать это, они использовали «протеомы» прошлых пандемических вирусных штаммов: preteome является всем накоплением аминокислот, сделанным когда все гены ворганизм выражается. Таким образом, в действительности то, что они сделали, было просмотреть все стандартные блоки белков, которые напрягают все гены предыдущей пандемиивыраженный и искал повторные структуры через штаммы.Они нашли 34 маркера аминокислоты, связанные, чтобы принять специфичность и высокую смертность.
Некоторые маркеры означали мало самостоятельно, но когдаобъединенный с «другими мутациями они улучшили прогноз класса», они нашли.«Эволюционные проводящие пути, вовлекающие человека H1N1 и штаммы свиньи, смешанные с птичьими штаммами, показывают потенциал, чтобы получить пандемические маркеры с aдвойная рекомбинация и одна или две мутации аминокислоты», написали они.Результаты исследования могут иметь важные последствия для того, как инструменты наблюдения могли отследить новые мутации эффективнее и проиллюстрировать «потенциал длярекомбинация и события мутации, чтобы привести к новым циркулирующим штаммам гриппа», сказал Аллен и Слизэк.«Сохраненные маркеры аминокислоты от прошлых штаммов пандемии гриппа».
Джонатан Э Аллен, Ши Н Гарднер, Элизабет А Виталис и Том Р Слезэк.BMC Microbiology2009, 9:77
Изданный: 22 апреля 2009doi:10.1186/1471-2180-9-77Дополнительный источник: Центральный Biomed.