Большая команда исследователей из нескольких институтов США.S. и Индия создала атлас анатомической транскрипции глиобластомы человека – агрессивной формы рака мозга. В своей статье, опубликованной в журнале Science, группа описывает процесс создания атласа и его содержание. Он называется «Атлас глиобластомы плюща».
Глиобластома, как отмечают исследователи, – чрезвычайно агрессивная форма рака мозга. Даже при самом передовом лечении большинство пациентов не живут более года после постановки диагноза. Из-за его уникальной природы исследователи пришли к выводу, что атлас необходим для объединения результатов исследовательских усилий. По их мнению, такой атлас поможет не только в текущих исследованиях, но и в диагностике и лечении пациентов.
Приступая к созданию атласа, исследователи отметили, что было проведено много исследований для понимания и контроля глиобластомы. Большая часть этого была сосредоточена на геномных изменениях, что привело к созданию профилей экспрессии генов, описывающих природу опухолей. Для создания атласа исследователи использовали записи, созданные для 41 фактического пациента, каждая из которых содержит общую информацию о пациенте, а также информацию о генетическом тестировании, которое было проведено для поиска сигнатур экспрессии. Во многих случаях описываются сигнатуры для различных частей данной опухоли – они предлагают информацию о дискретных типах клеток, которые могут служить целями для исследовательских усилий. Записи также обычно содержат гистологическую информацию о различных частях мозга. Он также включает отношения, которые наблюдались между клинической и геномной информацией.
Полученный атлас находится в свободном доступе в Интернете. Исследователи предлагают примеры его использования в исследовательских целях. В одном случае команда использовала его, чтобы отсеять потенциальные лекарственные препараты, направленные на определенные типы опухолей. Другая команда использовала его, чтобы сосредоточить внимание на областях опухоли, обнаруживая клетки, участвующие в инициации роста опухоли.
В дальнейшем исследователи полагают, что по мере развития атласа и добавления новой информации он станет ценным инструментом исследования и лечения.