Ваша слюна – ничто как Ваши соседи. Глобальное исследование нашло значительные отличия между людьми в типах микроорганизмов, населяющих их слюну – с удивительным отсутствием корреляции между типом жуков и где человек живет.До недавнего времени биомедицински ориентированные микробиологи были склонны сосредотачиваться на просто тех патогенах, которые могли быть выращены в лаборатории. Но в прошлое десятилетие, еще более дешевая последовательная технология позволила оптовые обзоры генов в окружающей среде, и от тех генов, оценок всех сообществ микроорганизмов, связанных с пищеварительным трактом и другими частями тела (Наука, 2 июня 2006, p. 1355).
Определенные составы сообщества, оказывается, факторы риска, скажем, при ожирении. В 2007 американские Национальные Институты Здоровья настраивают $115 миллионов, 5-летняя программа для взгляда всесторонними на микроорганизмы, найденные на или у людей.Но Марк Стонекинг не был всем, что заинтересовало здоровьем человека, когда он решил упорно искать микроорганизмы в слюне. Молекулярный антрополог в Макс.
Планке Институте Эволюционной Антропологии в Лейпциге, Германия, он и коллеги хотели знать, были ли швабры щеки или слюна лучшими источниками ДНК человека для использования в его исследованиях миграций населения. Они сделали некоторые испытания. «Вы действительно вытаскиваете огромную партию ДНК из слюны, но большая часть его, оказывается, бактерии», он вспоминает.
Это получило его взгляды. Он был впечатлен тем, как антропологи смогли проследить миграции населения через различия в напряжениях хеликобактер пилори жука живота в различных группах людей (Наука, 7 марта 2003, p. 1582; Наука, 23 января, p. 527). «С той разновидностью Вы видите очень сильное географическое копирование», говорит Стонекинг.
Но получение образца H. pylori является относительно трудным, поскольку это требует биопсии живота. Он задался вопросом, будет ли какая-либо из бактерий в слюне работать вместо этого.
Стонекинг убедил коллег помочь собрать слюну от 10 волонтеров каждый в дюжине мест во всем мире. Его лаборатория изолировала и упорядочила приблизительно 500 основ от гена, часто раньше говорил один тип бактерии от другого.
Они собрали приблизительно 120 последовательностей этого гена от каждого образца. Они тогда соответствовали тем последовательностям против тех в общественных базах данных для идентификации бактерий каждого человека.Взятый вместе, образцы содержали 101 известный бактериальный род, 39 из них недавно найденный во рту, отчеты бригады сегодня в Исследовании Генома.
Образцы также включали, другой оценил 64 рода, которые не были в базах данных. Люди имели между шестью и 30 видами бактерий в их ртах. У этих 10 человек из Калифорнии и 10 из Конго была самая большая разновидность; у тех из республики Грузия и Турции было наименьшее количество.Различия в бактериальном составе среди людей от определенного места имели тенденцию быть на одном уровне с различиями в подарке бактерий между людьми от различных мест, указывая – к удивлению бригады – что не было никаких географических образцов.
Исследователи также не сочли корреляцию между бактериями существующей и возраст, пол или факторы окружающей среды, такие как ливень. Можно было бы ожидать, что диета или гигиена будут влиять на микробные сообщества, но исследователи не оценили те культурные факторы в этом определенном исследовании. Таким образом у них есть немного подсказок относительно того, почему это разнообразие существует.«Эти сообщества очень сложны, и градус, к которому они варьируются между людьми, продолжает удивлять [нас]», говорит Рут Ли, микробовый эколог в Корнелльском университете.
Она хотела бы видеть, что исследователи контролируют исследование путем рассмотрения большего количества людей, взятия многократных образцов в течение долгого времени от каждого человека и получения большего количества последовательности от каждого образца. Такие усилия могут оказаться стоящими для больше, чем просто антропологических вопросов, говорит Дэниел Фэлуш, статистический генетик в Оксфордском университете в Соединенном Королевстве: «Разновидность в этой микробиоте может показать неожиданное понимание многих аспектов здоровья».