‘DivSeek’ стремится добывать генетическое сокровище в банковских хранилищах семени

divseek

Сельскохозяйственные банки генов надеются скоро прекратить служить прежде всего в качестве складов для семян растения и начинать извлекать выгоду из часто скрытого значения приблизительно 7 миллионов наростов семени, проводимых больше чем в 1 700 репозиториях во всем мире.Возникающий начальный, названный DivSeek, цели систематически охарактеризовать генетический, физический, и биохимический состав окруженных валом семян в надежде на эксплуатацию черт — таких как допуск засухи и сопротивление вредителя — который мог помочь произвести лучшие варианты урожая.

Консорциум DivSeek с 69 участниками, включающий ведущие в мире сельскохозяйственные научно-исследовательские центры, публично представляет усилие в Сан-Диего, Калифорния, сегодня перед ежегодной Международной конференцией по Геному Растения и Животного.“DivSeek является идеей, время которой настало”, говорит Питер Вензл, недавно нанятый ученый, который будет служить связью DivSeek от Глобального Треста Разнообразия Урожая в Бонне, Германия.

Это может принять к десятилетию для преобразования сырой идиоплазмы в новые варианты урожая, он отмечает, и развитие лучших способов охарактеризовать окруженные валом семена и поделиться информацией о них могло помочь ускорить процесс.Банки генов, хранящие бесчисленные варианты главных и незначительных продовольственных зерновых культур, долго рассматривались как важные игроки в помощи продовольственной безопасности адреса. Но развитие глобальной структуры для изучения и разделения этого генетического богатства было долгосрочной проблемой, отмеченной постоянными проблемами финансирования и, до принятия международного соглашения, иногда жестоких дебатов по тому, кто владеет и должен извлечь выгоду из окруженных валом семян. Возможно, самое большое препятствие гальванизировало желание и техническую способность скоординировать и финансировать совместное использование данных, говорит Хэннес Демпеуолф, ученый из Глобального Доверия Разнообразия Урожая.

DivSeek стремится ускорять процесс путем создания объединенного фронта. Международный консорциум включает 69 партнеров по государственному сектору, особенно 15 из крупнейших научно-исследовательских центров урожая в мире, известных как Консорциум CGIAR Международных Сельскохозяйственных Научно-исследовательских центров. Это также поддерживается организацией, управляющей Международным соглашением о Генетических ресурсах Растения для Еды и Сельского хозяйства (ITPGRFA), установивший глобальную систему для обмена идиоплазмы.Wenzl стал ранним защитником развития DivSeek после расхода прошлых 3 лет, возглавив международную программу за $70 миллионов под названием Семена Открытия, который genotyped десятки тысяч кукурузы и вступлений пшеницы в находящемся в Мексике Международном Центре Улучшения Кукурузы и Пшеницы, части системы CGIAR.

Опыт убедил его, что большая инициатива поделиться информацией на чертах и генах интереса будет благоприятна через более широкий диапазон зерновых культур.Одновременно, технические достижения, особенно более дешевый геном последовательные и прочные платформы совместного использования данных, упрощают собирать и широко делиться такой информацией, говорит Демпеуолф. “Мы видели то, что происходило в других секторах, таких как персонализированная медицина, и знало, что банки генов могли достигнуть много, намного быстрее и более эффективно, если только мы могли бы собрать правильных людей”.Первый шаг, организаторы DivSeek говорят, должен будет заставить генных банкиров и селекционеров растений договариваться о стандартах, инструментах, и протоколах, чтобы генерировать, организовать, и поделиться информацией на активах банка генов. Некоторые группы, например, уже работают над созданием глобальной системы уникальных идентификаторов для каждого вступления банка генов.

Онлайновая база данных под названием Genesys уже перечисляет содержание банка генов во всем мире и могла стать отправной точкой для сети связанных баз данных. И существует диапазон “опыта, платформ геномики, инструментов управления информацией и программного обеспечения, которое может быть разделено так, они полезны через диапазон зерновых культур”, говорит Вензл.

Те – в основном логистические препятствия. Краткосрочный вызов DivSeek будет объединять разрозненные группы — включая частные компании семени, финансируя управления, подрезать заводчиков и исследователей — позади определенного набора достижимых задач, говорит Демпеуолф.

И как разнообразие идиоплазмы документов коалиции, это не может “забыть о людях, генерирующих, поддерживающих, и постоянно увеличивающих то разнообразие — фермеры в развивающихся странах”, говорит Даниэле Манцелла, чиновник поддержки соглашения для ITPGRFA, координирующегося Продовольственной и сельскохозяйственной организацией ООН в Риме.Еще не ясно, как промышленность впишется. “Промышленность имеет значение, и будет интересно видеть, как это развивается”, говорит Манзелла. “Это не целесообразно улучшать способ, которым мы проводим исследование, если это не оказывает влияния на инновации”.“Сохранение разнообразия для пользы разнообразия хорошо, но в конце мы должны к … найти, где полезное разнообразие — гены для черт, которые селекционеры растений могут включить в новые разновидности — находятся”, говорит Брэдли Керц, старший менеджер интеллектуальной собственности в Инициаторе Дюпона, крупнейшая компания семени, базируемая под Де-Мойном.

Он поддерживает инициативу, говоря, что она могла окупиться для всех включенных.Также не ясно, какого количества деятельность DivSeek будет в конечном счете стоить — или как за это заплатят. Комментарий 2013 года по своей природе предположил подобную схему, стоящую $200 миллионов ежегодно. DivSeek еще не начал сбор средств, и некоторые, как Manzella, думают, что это должно остаться чистой операцией, особенно потому что финансирующие управления, кажется, интересуются отступающим банком семени, добывающим усилия.

Немецкое Управление для Международного сотрудничества, например, недавно финансировало проект за $1 миллион охарактеризовать больше чем 12 000 вариантов картофеля и батата в Международном Картофельном Центре в Лиме. “Я думал, что это было слишком большим из проекта до осуществленных разговоров DivSeek”, говорит Дэвид Эллис, глава банка генов центра. Кроме того, организация ITPGRFA скоро примет окончательное решение относительно финансирования для исследовательских проектов скоординировать обмен семенами, а также информацией с добавленной стоимостью, прибывающей из охарактеризования их.

Вензл предостерегает, что DivSeek не будет быстр для взлетания. “Существует старая африканская фраза: ‘Если Вы хотите пойти быстро, пойдите одни. Если Вы хотите пойти далеко, сочетаться’”, говорит он.

Но часы тикают, он добавляет: “Мы должны выяснить, как установить глобальные приоритеты ради продовольственной безопасности”.


VIRTU-VIRUS.RU