Надеясь приручить поток данных, крутящихся из лабораторий биологии, Национальные Институты Здоровья (NIH) сегодня объявили о $32 миллионах в премиях в 2014, чтобы помочь исследователям развить способы проанализировать и использовать большие биологические наборы данных.Премии выходят из Больших Данных NIH к Знанию (BD2K) инициатива, о которой объявляют в прошлом году после того, как NIH пришел к заключению, что это должно было вложить капитал больше в усилия использовать растущее число наборов данных — от геномики, протеинов и отображения к терпеливым учетам — который накапливают биомедицинские исследователи. Например, в одной такой “сухой биологии” проект, исследователи смешали общественные данные по экспрессии гена в клетках и пациентах с болезнями для предсказания нового использования для существующих наркотиков.Премии BD2K “помогут нам преодолеть препятствия максимизации полезности гигантских наборов данных, появляющихся в ускоренном темпе”, заявил директор NIH Фрэнсис Коллинз в требовании сегодня с репортерами.
Гранты, он сказал, поддержат вычислительные аппараты, программное обеспечение, стандарты и методы для разделения и использования больших наборов данных.Одиннадцать центров передового опыта получат $2 миллиона к $3 миллионам в год более чем 4 года для развития инструментов и методов для всего от моделирования сигнализации клетки при раке к объединяющимся данным от мобильных датчиков, изношенных волонтерами в медицинских исследованиях. Другая премия центра поддержит глобальное мозговое усилие сбора данных под названием ЗАГАДКА, стремящаяся раскапывать генетические корни психических расстройств.
Одна из целей ЗАГАДКИ состоит в том, чтобы позволить нейробиологам и генетикам объединять сотни тысяч образцов ДНК в надежде на нахождение генетических вариантов, лежащих в основе болезней, таких как серьезное депрессивное расстройство. Меньшие исследования не подняли ничего статистического значения для этого беспорядка, возможно потому что много различных генов вносят мелкие результаты в риск депрессии, которые ранее были слишком маленькими для обнаружения, говорит Пол Томпсон, нейробиолог в университете южной Калифорнии в Лос-Анджелесе. Он возглавит Центр ЗАГАДКИ Глобальной Медицины, Отображения и Геномики.Исследования нейроотображения также долго боролись с недостаточными данными, говорит Хью Гаравэн, познавательный нейробиолог в Университете Вермонта в Берлингтоне, недавно присоединившийся к ЗАГАДКЕ.
Примерно “95% всех исследований отображения имеют, возможно, 20 участников за группу”, в основном из-за стоимости сканирований головного мозга, которые могут управлять примерно 500$ к 600$ на человека, говорит он. Группа Гаравэна планирует использовать объединенные данные для исследования генетики и нейробиологии склонности, говорит он.
ЗАГАДКА может также помочь ученым изучить различия в толщине человеческой коры, морщинистом слое ткани, находящейся на поверхности мозга и выполняющей большую часть нашего мышления более высокого уровня. Обычно, требуется по крайней мере 24 часа для извлечения информации о толщине коры от просмотра MRI — нужно в цифровой форме раздеться от черепа, отделить белое вещество от серого вещества и удалить цереброспинальную жидкость. Доступ к суперкомпьютерным группам позволит нейробиологам обрабатывать намного более быстро, что тип набора данных для сотен тысяч пациентов, говорит он.
Несмотря на то, что более крупные наборы данных действительно повышают риск получения более ложных положительных результатов и пропавших без вести редких разновидностей, в целом объединяющая данные стратегия “имеет совершенный смысл”, говорит психиатр Джек Макклеллан Сиэтла Детская Больница в Вашингтоне, не вовлеченная в проект ЗАГАДКИ.Программа BD2K также финансирует “координационный центр” открытия данных в Калифорнийском университете, Сан-Диего, который будет работать с проектами в восьми других учреждениях для нахождения способов упростить для исследователей находить и использовать наборы данных. Прямо сейчас, “Вы не можете научная информация Google очень успешно”, говорит Филип Боерн, который это в прошлом январе стало первым заместителем директора NIH науки данных.Наконец, ряд учебных премий поддержит курсы и работу молодых ученых, работающих над большими проектами данных.
NIH ожидает передавать в общей сложности $656 миллионов к 2020 инициативе BD2K.