Изучение 130 исследований экспрессии генов в 10 солидных раковых опухолях показало, что когда любой из четырех родственных генов сверхэкспрессируется, пациенты имеют гораздо худшие результаты, включая снижение выживаемости.
Исследователи из Джорджтаунского онкологического центра Ломбарди говорят, что их исследование, опубликованное в феврале. 3 в Oncotarget, показывает, что это семейство генов Ly6 позволяет раковым клеткам действовать как раковые стволовые клетки, которые продолжают делиться и расти без остановки.
"Это замечательные находки. Мы считаем, что это семейство генов вызывает рак, который легко метастазирует, устойчив к лекарствам и его очень трудно уничтожить," говорит старший научный сотрудник исследования, Гита Упадхьяй, доктор философии, доцент кафедры онкологии Джорджтауна Ломбарди.
Упадхьяй и ее сотрудники в настоящее время работают над новыми агентами, которые могут ингибировать экспрессию гена Ly6.
Первоначально исследование Upadhyay было основано на Sca1, гене, который исследователи мыши используют для проверки наличия раковых стволовых клеток у животных. В 2011 году она обнаружила, что Sca1 – это больше, чем просто биомаркер – он играет ключевую роль в создании и поддержании качества стволовых клеток в раковых клетках.
Затем она посмотрела, работает ли Sca1 таким же образом у людей, и нашла семейство генов Ly6, которые отображаются в том же хромосомном месте у людей, где Sca1 находится в геноме мыши. Семейство генов Ly6 также структурно сходно с Sca1.
Это исследование было разработано, чтобы определить, важен ли какой-либо из генов семейства Ly6 при раке человека.
Исследователи использовали 130 опубликованных, общедоступных исследований, которые включали информацию о генах пациентов и исходах их рака. Некоторые исследования взяты из Джорджтаунской базы данных по раку; другие были доступны в Национальных институтах здоровья.
Они обнаружили, что четыре разных члена семейства – Ly6D, Ly6E, Ly6H или Ly6K – не активны в нормальных тканях, но экспрессируются в мочевом пузыре, головном мозге и центральной нервной системе, колоректальном, шейном отделах, яичниках, легких, голове и шее, поджелудочной железе. и рак простаты. Исследователи также обнаружили, что высокая экспрессия этих генов связана с плохими результатами и снижением выживаемости при раке яичников, толстой кишки, желудка, легких, мочевого пузыря, головного мозга и центральной нервной системы.
"Корреляция между экспрессией гена Ly6 и плохой выживаемостью пациентов при нескольких типах рака указывает на то, что это семейство генов будет иметь важное значение в клинической практике – не только как маркер плохого прогноза, но и как мишени для новых лекарств," Упадхьяй говорит.
Это исследование больших данных подтверждает "рак самогон" предложение ускорить исследования, объявленное президентом Обамой в обращении о положении дел в этом году, говорит Упаддхьяй. "Область рака быстро прогрессирует, когда исследователи обмениваются данными, и это исследование, в котором изучается работа множества исследовательских групп, показывает, что можно сделать."
"Мы применили биоинформатические инструменты, чтобы изучить клиническое значение увеличения LY6 в исходе выживаемости при нескольких типах рака. Инструменты системной биологии имеют решающее значение для управления фундаментальными исследованиями для решения критических клинических проблем и выявления новых узловых сигналов, таких как этот," говорит соавтор Субха Мадхаван, доктор философии, директор инновационного центра биомедицинской информатики в Джорджтауне.