И теперь исследователи в Медицинском центре Университета Вандербилт нашли способ искать генетические данные в электронной медицинской документации, чтобы определить эти болезни в значительной части населения, таким образом, лечение может быть скроено к фактической причине болезни.Последствия для результатов сообщили сегодня в журнале Science, широкие и многочисленные – у 14 процентов пациентов с генетическими вариантами, затрагивающими почку, были почечные пересадки, и 10 процентов с другим вариантом потребовали пересадок печени.
Если бы их генетическая причина была диагностирована, тех пересадок, возможно, избежали.«Мы начали с простой идеи: ищите группу признаков и болезней, чтобы найти невыявленную основную болезнь», сказал Джош Денни, Мэриленд, Миссисипи, преподаватель Биомедицинской Информатики и Медицины и директора Центра Медицины Точности.
«Тогда мы вошли в азарт действительно, когда мы видели, как мы могли систематизировать его через тысячи генетических заболеваний, чтобы выяснить воздействие миллионов генетических вариантов», сказал он.Новый метод, разработанный Денни, Лайзой Бэстарач, Миссисипи, и команда сотрудников, создает счет риска фенотипа, чтобы найти образцы признаков, которые могут быть вызваны основным генетическим вариантом – включая некоторые генетические варианты, эффекты которых были ранее неизвестны.Авторы теоретизировали, что многие пациенты, в настоящее время диагностируемые проблемы, такие как сердечная недостаточность, удар, бесплодие или почечная недостаточность, могли бы на самом деле страдать от редкого генетического заболевания. Если та основная болезнь могла бы быть определена, у нее может быть определенное лечение, препятствующее тому, чтобы признаки повторились или ухудшились.
Сливая традиционные ресурсы с более новыми методами сбора данных, авторы назначили очки 21 701 человеку на основе того, как хорошо их список признаков соответствует клиническому описанию каждого из 1 204 различных генетических заболеваний. Получающийся счет риска фенотипа высок для людей, которые являются близким соответствием и низко для людей, которые испытывают недостаток в особенностях ключей болезни.
«Что счет риска фенотипа показывает нам, то, что, если Вы начинаете с определенных комбинаций признаков, возможности нахождения потенциально причинного генетического варианта довольно высоки. Это – действительно важный шаг к использованию клинического генотипирования, чтобы оценить терпеливый риск и сообщить более точной профилактике и лечению общих условий», сказали соавтор Дэн Роден, Мэриленд, первый вице-президент по Персонализированной Медицине.Исследователи нашли 18 ассоциаций между генетическими вариантами и высокими очками риска фенотипа. Некоторые известны генетикам, таковы как два варианта, которые вызывают муковисцедоз, но большинство ассоциаций было для вариантов, которые не были ранее описаны.
Люди для этого исследования открытия были привлечены из BioVU, одного из самых больших хранилищ его добрых образцов ДНК соединения к de-identified электронной медицинской документации. Команда тогда копировала их результаты во втором биобанке в Клинике Маршфилда и подтвердила их посредством тестов в лабораториях в VUMC и Университете Оклахомы.Исследование также обеспечивает важное понимание природы наследования болезни.
До сих пор врачи предположили, что генетические заболевания, названные «удаляющимися», требуют, чтобы две мутации (один от каждого родителя) стали симптоматическими. Однако исследователи нашли, что только один вариант был достаточно для некоторых болезней, чтобы повлиять на здоровье пациента.«Ввиду наших результатов знакомые медицинские категории, такие как ‘комплекс’ против ‘генетического’, или ‘доминирующий’ против ‘удаляющегося’ начинают появляться больше как континуумы», сказал Бэстарач, ведущий ученый данных с Центром VUMC Медицины Точности.
Поскольку генетическое тестирование больше распространено, есть возрастающая потребность понять воздействие генетических вариантов. Только часть редких генетических вариантов, найденных в людях, хорошо понята. Это исследование показывает, что рассмотрение результатов в электронной медицинской документации может быть полезным в решении, если вариант мог бы быть, связан с болезнью.
«Фенотип рискует выигрывать, может легко быть применен в любой электронной системе медицинской документации, которая связана с ДНК», сказал Бэстарач. «Наша работа посмотрела на только небольшую выборку генома человека, приблизительно 6 000 вариантов. Возможность для дополнительных открытий, используя этот метод огромна».Исследование объединяет усилия 27 авторов: Лайза Бэстарач, Джейк Хьюи, Джой Марло, Сара Ван Дрист, Трейси Макгрегор, Джонатан Мосли, Квинн Уэллс, Майкл Темпл, Андреа Рамирес, Роберт Кэрролл, Трэвис Остерман, Тодд Эдвардс, Дуг Рудерфер, Дигна Эдвардс, Rizwan Hamin, Джой Когэн, Эндрю Глейзер, Вэй-Ци Вэй, QiPing Фэн, Нэнси Кокс, Дэн Роден и Джош Денни, работающий в VUMC; Скотт Хеббринг и Мюррей Бриллиант в Клинике Маршфилда; и Ванькэ Чжао, Желание Хо и Чжичжуан Чжао в Университете Оклахомы.
Работа была поддержана грантами от Национальных Институтов Здоровья (LM010685, LM011939, LM007359, HG004603, HG006378, HG008672, HG008341, RR024975, TR000445, GM114128, GM115305, GM120523, HL133786, HG009086).