Крупнейшее в истории исследование по секвенированию полных геномов рака груди выявило пять новых генов, связанных с заболеванием, и 13 новых мутационных сигнатур, влияющих на развитие опухоли. Результаты двух статей, опубликованных в журналах Nature и Nature Communications, также показывают, какие генетические вариации существуют при раке груди и где они встречаются в геноме.
Доктор Серена Ник-Зайнал из института Wellcome Trust Sanger провела анализ 560 геномов рака груди; 556 от женщин и четыре от мужчин. В это международное сотрудничество вошли пациенты с раком груди со всего мира, включая США, Европу и Азию.
Результаты раскрывают больше о причинах опухолей груди и свидетельствуют о том, что геномы рака груди очень индивидуальны.
Геном рака каждого человека – это полный исторический отчет о генетических изменениях, которые они приобрели на протяжении всей жизни. Когда человек превращается из оплодотворенной яйцеклетки во взрослую жизнь, ДНК в его клетках накапливает генетические изменения на этом пути. Это связано с тем, что человеческая ДНК постоянно повреждается окружающими предметами или просто из-за износа клетки. Эти мутации образуют паттерны или мутационные сигнатуры, которые мы можем обнаружить, и они дают нам подсказки о причинах рака.
Команда доктора Ник-Зайнала выискивала мутации, которые стимулируют рост рака, и искала мутационные сигнатуры в опухоли каждого пациента. Они обнаружили, что женщины, несущие ген BRCA1 или BRCA2 и, следовательно, имеющие повышенный риск развития рака груди и яичников, имели профили полных геномов рака, которые сильно отличались друг от друга, а также сильно отличались от других видов рака молочной железы. Это открытие можно использовать для более точной классификации пациентов для лечения.
Доктор Ник-Зайнал сказал: "В будущем мы хотели бы иметь возможность профилировать индивидуальные геномы рака, чтобы мы могли определить лечение, которое, скорее всего, будет успешным для женщины или мужчины, у которых диагностирован рак груди. Это еще один шаг к индивидуальному подходу к лечению рака."
Также важно, где именно происходят мутации в геномах рака груди.
Сотрудник доктор Эван Бирни из Европейского института биоинформатики использовал вычислительные методы для анализа последовательности генетической информации, содержащейся в каждом из образцов геномов. Он сказал: "Мы знаем, что генетические изменения и их положение в геноме рака влияют на то, как человек реагирует на лечение рака. В течение многих лет мы пытались выяснить, играют ли части ДНК, которые не кодируют что-либо конкретное, роль в развитии рака. Это исследование дало нам первое крупномасштабное представление об остальной части генома, раскрывая некоторые новые причины возникновения рака груди, и дало нам неожиданный способ охарактеризовать типы мутаций, которые происходят при определенных формах рака груди."
Профессор сэр Майк Стрэттон, директор института Wellcome Trust Sanger, сказал: "Все виды рака возникают из-за мутаций, которые происходят у всех нас в ДНК наших клеток в течение нашей жизни. Обнаружение этих мутаций имеет решающее значение для понимания причин рака и разработки более эффективных методов лечения. Это огромное исследование, в котором очень подробно рассматриваются многие тысячи мутаций, присутствующих в каждом из геномов 560 случаев, приближает нас к полному описанию изменений в ДНК при раке груди и, таким образом, к всестороннему пониманию причин заболевания. и возможности для новых методов лечения."