Исследователи в Германии сегодня отправили по почте первую версию с высокой разрешающей способностью генома потухшего человека на веб-сайте для Макс. Планка Института Эволюционной Антропологии. Цель: позволить коллегам загружать доступные данные наиболее полной последовательности бесплатно.Год назад исследователи издали первый черновой набросок генома архаичной девочки, жившей в Денизовой Кейв, Сибирь, по крайней мере 30 000 лет назад.
В январе Макс. Планк палеогенетик Сванте Пабо был на встрече в Швеции, когда он понял, что исследователи в других лабораториях детально изучали годовалые данные о последовательности, которые были намного менее полными, чем, что его коллеги получили в лаборатории в прошлом году с помощью чувствительных, новых методов для упорядочивания древней ДНК. «Я плохо себя чувствовал, зная, что у нас была эта намного лучшая версия того же генома и что это будет за несколько месяцев до того, как это стало доступным», говорит Паабо.Так, Paabo и его коллеги решили позволить их коллегам загружать данные о последовательности для генома с высокой разрешающей способностью сегодня, даже при том, что они все еще подготавливают газету для публикации их результатов от изучения генома.
Бригада теперь упорядочила каждое положение в ее геноме среднее число 30 раз, с помощью ДНК, извлеченной меньше чем из 10 миллиграммов кости пальца древней девочки. Это «30x» освещение обеспечивает более подробную информацию, чем 1.9-кратное освещение бригада, изданная по своей природе в конце декабря 2010.
Более высокая резолюция означает Paabo, и его коллеги могут теперь сравнить даже небольшие различия в копиях генов, которые определяет эта древняя девочка, унаследованная от ее матери и отца — и, как ее ДНК отличается точно от того из живущих людей и Neandertals. Девочка была более тесно связана с Neandertals, чем современные люди, но ее геном не был в диапазоне разновидности, найденной в Neandertals до сих пор. Neandertals, Denisovans и современные люди все жили в Азии в приблизительно то же время и скрестились на низких уровнях; современные люди на Меланезии и других частях Азии унаследовали приблизительно 4% своей ДНК от Denisovans.
Исследователи теперь исследуют последовательность эскиза, полученную из древней ДНК девочки, чтобы попытаться видеть точно, какие гены современные люди унаследовали от Denisovans. «Мы осторожны о разговоре о результатах, поскольку мы намереваемся представить статью с исследованиями скорее скоро», говорит Паабо. Но он говорит, что высокое освещение генома девочки позволяет видеть сколько генетического изменения, там был в ее популяции Denisovans.
Он добавляет, что это также позволяет сделать «всесторонний и чрезвычайно полный каталог всех изменений», ставших фиксированными в геномах современных людей, так как наши предки разошлись с Denisovans.