Исследование исследовало ДНК methylation – «аннотация» ДНК, которая изменяет экспрессию гена, не изменяя саму геномную последовательность – в группе разнообразных латиноамериканских детей. Methylation – один тип «эпигенетической отметки», которую показало предыдущее исследование, может быть или унаследован или изменен жизненным опытом.
Исследователи определили несколько сотен различий в methylation, связанном или с мексиканской или с пуэрториканской этнической принадлежностью, но обнаружили, что только три четверти эпигенетического различия между двумя этническими подгруппами могли составляться различиями в детской генетической родословной. Остальная часть эпигенетических различий, авторы предлагают, может отразить биологическую печать, сделанную различными событиями, методами и экологическими воздействиями, отличными двум этническим подгруппам.
Открытие могло помочь ученым понять, как социальные, культурные, и факторы окружающей среды взаимодействуют с генетикой, чтобы создать различия в последствиях для здоровья между различным этническим населением, авторы говорят, и предоставляет контрапункт давним усилиям в биомедицинском научном сообществе заменить неточную расовую и этническую классификацию генетическими тестами, чтобы определить родословную.«Эти данные предполагают, что взаимодействие между гонкой и этнической принадлежностью как социальные конструкции и генетическая родословная как биологическая конструкция более сложно, чем мы поняли», сказал Ноа Зэйтлен, доктор философии, доцент UCSF медицины и co-ведущий-автор на новом исследовании. «В медицинском контексте оба элемента могут предоставить ценную информацию».
Исследование – изданный 3 января 2017 в iLife сетевого журнала – было во главе с Джошуа Галантером, Мэриленд, МКЛ, раньше доцент медицины, биоинженерии и терапевтических наук, и эпидемиологии и биостатистики в UCSF, кто теперь ученый из Genentech. Исследование совместно контролировалось Зэйтленом и co-ведущим-автором Эстебаном Бурчардом, Мэриленд, MPH, преподавателем биоинженерии и терапевтических наук и медицины в школах UCSF Аптеки и Медицины и Гарри Вм. и Диана В. Хинд Дистингуишед Профессоршип в Фармацевтических Науках II в UCSF.«Это – большое продвижение нашего понимания гонки и этнической принадлежности», сказал Бурчард. «Есть эти целые дебаты о том, существенно генетическая ли гонка или является просто социальной конструкцией.
К нашему знанию это – первый раз, когда любой попытался определить количество молекулярной подписи негенетических компонентов гонки и этнической принадлежности. Это демонстрирует совершенно новым способом, которые мчатся, объединяет и генетику и окружающую среду».Дразня обособленно роли генетики, окружающей среды в этнических различиях в болезни
Исследователи и клиницисты много лет знали, что различное расовое и этническое население заболело болезнями по различным ставкам, по-другому отвечает на лекарства и показывает совсем другие результаты на стандартных клинических тестах: «Для целого диапазона медицинских тестов, говорят ли Вашему врачу, что Ваш результат лаборатории нормален или неправильный, зависит полностью от коробки гонки/этнической принадлежности, которую Вы помечаете на форме потребления», сказал Зэйтлен.Заманчиво предположить, что такие медицинские различия между гонками и этническими принадлежностями вся основа от унаследованных генетических различий, но это не обязательно имеет место.
Различные расовые и этнические группы также едят различные диеты, живые в районах с более или менее загрязнением, испытывают разные уровни бедности и, более или менее вероятно, будут курить табак, все из которых могли также повлиять на их последствия для здоровья.«Большое наше исследование включает попытку дразнить обособленно, сколько из медицинских различий между населением является генетическим и сколько является экологическим», сказал Зэйтлен.Исследователи обратились к эпигенетике, чтобы искать ответы на эти вопросы, потому что у этих молекулярных аннотаций генетического кода есть уникальное положение между генетической родословной и экологическим влиянием. В отличие от остальной части генома, который только унаследован от родителей человека (со случайными мутациями тут и там), methylation и других эпигенетических аннотаций может быть изменен на основе опыта.
Это влияние модификаций, когда и где определенные гены выражены и, кажется, оказывают значительные влияния на риск заболевания, предлагая объяснения того, как факторы окружающей среды, такие как материнское курение во время беременности могут влиять на риск ребенка более поздних проблем со здоровьем.Эпигенетические подписи этнической принадлежности могли быть биомаркерами для общих культурных событий
В новом исследовании команда исследовала methylation подписи в 573 детях идентифицировавшей себя мексиканской или пуэрториканской идентичности, оттянутой из исследования ГАЛЫ II, когорта, ранее развитая Burchard, чтобы изучить экологические и генетические компоненты риска астмы в латиноамериканских детях. Они определили 916 methylation мест, которые менялись в зависимости от этнической идентичности, но нашли, что только 520 из этих различий могли быть полностью объяснены генетической родословной – 109, мог быть частично объяснен родословной, в то время как 205 не мог быть объяснен родословной вообще.В целом, исследователи нашли, что приблизительно 76 процентов эффекта этнической принадлежности на ДНК methylation могли составляться, управляя для генетической родословной, предлагая, чтобы почти четверть эффекта произошла из-за другого, неизвестных факторов. Исследователи нашли, что многие из этих дополнительных methylation мест соответствовали местам, которые предыдущие исследования показали, чтобы быть чувствительными к факторам окружающей среды и социальным факторам, таким как материнское курение, воздействие дизельного выхлопа и психосоциологическое напряжение.
Это принудило команду выдвигать гипотезу, что большая часть их недавно disovered эпигенетические маркеры этнической принадлежности, вероятно, отражает биологические подписи экологических, социальных, или культурных различий между этническими подгруппами.«Это предполагает, что, используя эпигенетику, поскольку биомаркер мог дать Вам большую информацию об экологических воздействиях в конкретном населении, это не захвачено генетикой», сказал Зэйтлен. «Наш следующий шаг должен будет понять, как определенные эпигенетические подписи связаны с конкретными экологическими воздействиями и используют те сигналы понять терпеливый риск».
Ученые и клиницисты все больше и больше пытались переехать от упрощенных расовых и этнических категорий в исследовании болезни, авторы говорят, и – с продвижением медицины точности – в клиническом диагнозе и лечении также. Исследования группы Burchard и других нашли, что использование генетической родословной, а не этнической самоидентификации значительно улучшает диагностическую точность для определенных болезней.Но новые данные, показывающие, что большая часть эпигенетических подписей этнической принадлежности отражает что-то другое, чем родословная, предполагают, что отказ от идеи гонки и этнической принадлежности в целом мог пожертвовать большой ценной информацией о водителях различий в здоровье и болезни между различными сообществами.«Как стандартная семейная история, этническая принадлежность – связь с болезнью и по генетическим и по экологическим причинам», сказал Зэйтлен. «Если у Вашего папы или мамы был сердечный приступ, который говорит врачам много о Вашем риске для сердечного приступа.
Часть этого генетическая, но часть ее – то, что на Ваш образ жизни влияет в большой степени образ жизни Ваших родителей. Ваша этническая группа похожа на намного более многочисленную семью – это – частично вопрос генетики, но это также отражает среду Вашего более широкого сообщества».