Агрессивный non-typhoidal Сальмонеллез (iNTS) в настоящее время уносит жизни приблизительно 400 000 человек в год в Африке к югу от Сахары. Это вызвано типом Сальмонеллы Typhimurium (ST313), который обычно затрагивает людей с ослабленными иммунными системами, является очень стойким к антибиотикам и может развиваться в инфекции кровотока.Новое исследование, изданное сегодня в Медицине Генома, определило различный и намного менее опасный штамм бактерий ST313 в Великобритании и определило ключевые геномные различия, которые помогают ученым понять, почему африканское напряжение вызывает такой высокий уровень болезни.Исследовательская группа проанализировала ДНК больше чем 3 000 Сальмонелл образцы Typhimurium, собранные Public Health England с 2014, и обнаружила, что 2,7% были бактериями ST313.
Однако Великобритания-ST313 отличается от вариантов ST313, найденного в живущем к югу от Сахары африканце. Инфекция, вызванная Великобританией-ST313, обычно является менее тяжелой желудочно-кишечной болезнью, и бактериальные штаммы были восприимчивы к большинству антибиотиков.
Дальнейший анализ показал отличные и потенциально важные различия между британской и африканской Сальмонеллой с африканскими бактериями все содержащие ДНК двух вирусов, интегрированных в их хромосомы.Совместный ведущий автор Сиань Оуэн, от Института Университета Интегральной Биологии, сказал, что «Наши результаты предполагают, что эти два вируса всегда находятся у африканской Сальмонеллы ST313, все же никогда в британском варианте. Такая прочная ассоциация предполагает, что приобретение этих вирусов, возможно, было важным событием для развития африканского напряжения.
Британские геномы ST313 помогают нам соединить загадку того, как африканская Сальмонелла развилась».Команда также проанализировала геномы Сальмонеллы для генетических мутаций, которые могли затронуть способность бактерий вызвать болезнь. Один из ST313 изолирует определенный, который был транспортирован в Великобританию из Африки, нес мутацию, которая могла иметь последствия для будущего развития вакцины, а также новую комбинацию генов устойчивости к антибиотикам.Профессор Джей Хинтон, который возглавляет исследовательскую группу Ливерпульского университета, объяснил: «Хотя клиническая картина эпидемии Сальмонеллы в Африке известна, мало известно о биологии болезнетворного микроорганизма ST313, делая его тяжелее, чтобы разработать эффективные стратегии управления.
Это исследование подчеркивает ценную роль, которую обычное геномное упорядочивание здесь в Великобритании может играть, чтобы улучшить наше понимание, и помощь занимаются действительно важной проблемой со здоровьем в развивающихся странах».Доктор Тим Даллмен, из Public Health England, добавил: «Идентификация этой новой британской популяции Сальмонеллы была только сделана возможной недавним введением обычного целого генома, упорядочивающего из образцов Сальмонеллы, которые вызывают человеческую болезнь в Англии и Уэльсе, позволяя нам сделать важные открытия, которые были бы пропущены обычными микробиологическими методами».
Исследователи теперь выполняют подробное сравнение британских и африканских вариантов ST313, чтобы попытаться понять, почему африканская Сальмонелла вызывает такой высокий уровень болезни.