Ученые OHSU открыли метод быстрого и эффективного картирования генома отдельных клеток в организме. Их выводы будут опубликованы в январе. 30 в журнале Nature Methods, открывает путь к значительному прогрессу в точной медицине, включая рак и многие другие области болезней.
Секвенирование одноклеточного генома оказалось полезным для обнаружения изменений внутри клеток, особенно внутри опухолей. Однако отсутствие эффективного и экономичного метода картирования генома большого количества отдельных клеток затрудняет проведение такого надежного анализа, который необходим для характеристики конкретного генетического состава раковых опухолей, поражающих людей, или других типов клеток. в теле.
В исследовании демонстрируется метод многократного штрих-кодирования клеток с последующим их секвенированием. Метод значительно увеличивает количество отдельных ячеек, которые можно сопоставить.
"Опухоль постоянно развивается и постоянно меняется," сказал старший автор Эндрю Адей, доктор философии.D., доцент кафедры молекулярной и медицинской генетики Медицинского факультета OHSU. "Если мы сможем разрушить отдельные клеточные компоненты опухоли, мы сможем нацелить рак гораздо точнее."
Используя свой метод индексации клеток, исследователи построили геномные библиотеки для 16698 отдельных клеток – примерно на два порядка больше, чем можно было бы достичь с помощью обычных методов. На следующем этапе работы Адей надеется расширить типы информации, к которой можно получить доступ в отдельных клетках, включая эпигенетические свойства, которые сильно различаются между разными типами клеток в организме.
"Это позволит добиться больших успехов," Адей сказал. "Благодаря сотрудничеству с другими исследователями из OHSU мы надеемся довольно быстро начать использовать этот инструмент в условиях клинических исследований."