Впервые исследователи провели большое испытание, в ходе которого они протестировали весь геном отдельных видов рака груди, чтобы помочь персонализировать лечение. Они представили свои выводы на Конгрессе ESMO 2012 Европейского общества медицинской онкологии в Вене.
В последние годы был разработан ряд лекарств, направленных на специфические генетические изменения при раке. Чтобы выбрать, какие из этих препаратов подходят отдельным пациентам, проводится генетическое тестирование. "В большинстве этих случаев эти подходы к генетическому тестированию анализируют только ограниченное количество генов," сказал автор исследования доктор Фабрис Андре из Института Густава Русси, Вильжюиф, Франция.
Теоретическое преимущество тестирования всего генома состоит в том, что этот подход может идентифицировать как частые, так и редкие неожиданные геномные события. "Кроме того, это позволяет нам количественно оценить уровень нестабильности генома и определить, связаны ли мутации драйвера с геномными изменениями, участвующими в устойчивости к целевым агентам," Доктор Андре сказал.
С точки зрения предоставления медицинских услуг и политики, разработка полногеномных подходов также означает, что не нужно разрабатывать новые биотесты для каждой новой цели, обнаруженной при раке.
В исследовании SAFIR01 д-р Андре и его коллеги разработали программу, в которой весь геном из биопсии метастатического поражения был проспективно проанализирован для отдельных пациентов с метастатическим раком молочной железы. Они использовали массив CGH (aCGH) и секвенирование по Сэнгеру для выявления генетических изменений в метастатической ткани, что позволило им определить, какие гены были мутированы, амплифицированы или удалены. Эта геномная информация была проспективно использована для предложения различных таргетных методов лечения. Исследование было проведено и спонсировано UNICANCER при финансовой поддержке Национального института рака Франции.
По состоянию на 23 сентября 2012 г. биопсия была выполнена у 402 больных раком груди, в том числе 26 пациентов, анализы которых продолжаются. Из них геномный результат может быть получен у 276 пациентов, включая анализ всего генома у 248 пациентов. Геномное изменение "целевой" д-р Андре сказал, что противоопухолевый препарат был обнаружен у 172 из этих пациентов. Интересно, что примерно у 20% пациентов наблюдались очень редкие и иногда неожиданные изменения генома, что подчеркивает необходимость полногеномных подходов.
"Основная идея заключается в том, что полногеномные подходы могут быть реализованы в контексте повседневной практики в больших когортах, что позволяет нам идентифицировать цели, которые могут быть подавлены у значительной части пациентов, что приводит к противоопухолевым эффектам. Это исследование показывает, что пришло время применить персонализированную медицину в области борьбы с раком," Доктор Андре сказал.
Хотя только небольшая часть пациентов нуждалась в исследуемом агенте после биопсии, 26 пациентов на данный момент получили целевой агент, соответствующий геномному изменению. Цель состоит в том, чтобы охватить более 80 пациентов, которых лечили целевым агентом.
"Когда результаты исследования SAFIR01 и его пилотной фазы объединены, 18 из 48 пациентов, получавших лечение согласно полногеномному анализу, представили доказательства противоопухолевой активности," Доктор Андре сказал.
"Мы думаем, что в будущем полногеномные подходы к геномному тестированию рака станут стандартом лечения, поскольку они обеспечивают полную картину геномных изменений и простой способ тестирования биомаркеров," Доктор Андре заключил.
Комментируя данные, доктор Питер Дубски, доцент хирургии Венского медицинского университета (не принимавший участия в исследовании), сказал: "SAFIR01 – это замечательное достижение, благодаря которому персонализированное молекулярное вскрытие рака груди стало доступным для клинической практики."
"Исследователи смогли проанализировать большие части индивидуального генома рака молочной железы и, кроме того, добились успеха в выявлении молекулярных изменений с хорошими шансами на ответ на конкретное лечение," Доктор Дубский сказал. "Другими словами, они создают возможность выявления «лекарственно-пригодных» мишеней у женщин, демонстрирующих прогрессирование метастатического заболевания. Как технические достижения, так и организационные и этические препятствия, преодолеваемые французским консорциумом, представляют собой целенаправленное и клинически значимое исследование в лучшем виде."
"Французский консорциум открыл новую дверь для более персонализированного лечения распространенного рака груди," Доктор Дубский сказал. "Клинические исследования должны будут рассмотреть клиническую полезность таких подходов по сравнению с текущими стандартами."
Доктор Дубский сказал, что еще предстоит обсудить несколько вопросов: "Биопсия метастазов (особенно для получения высококачественной ДНК) не всегда возможна, дорогостоящая и может привести к дополнительным осложнениям. Учитывая недавние открытия, полученные с помощью методов секвенирования следующего поколения, стоит задаться вопросом, насколько релевантна ткань из места метастазирования. Другими словами, в будущем свежей ткани из первичной ткани будет достаточно для скрининга мишеней для лекарств?"
"Также важно отметить, что определение подтипов рака груди уже стало клинической реальностью при лечении запущенных и ранних стадий заболевания. Онкологи могут анализировать подтипы рака груди на основе рецепторов гормонов, экспрессии Her2-neu и маркеров дифференциации и разрастания опухоли. Полногеномные подходы необходимо будет сравнить с нынешним золотым стандартом с точки зрения их клинической применимости."
По словам д-ра Дубски, недавно нацеливание на путь PI3K / mTOR с использованием ингибитора mTOR в сочетании с экземестаном привело к значительному улучшению клинической пользы у женщин с метастатическим гормональным рецептором-положительным и Her2neu-отрицательным раком молочной железы. "Примечательно, что эта мишень была основана на молекулярных исследованиях. Однако пациенты, которым эта новая комбинация лечения была бы полезна, были отобраны клинически: были отобраны женщины, у которых развилась эндокринная резистентность к предшествующему эндокринному лечению, и они показали значительную клиническую эффективность. Клинические испытания, предоставившие эти доказательства, были успешными без индивидуальной молекулярной идентификации мишени лечения."