Теперь, образцы, найденные в геномах аутичных детей – полном комплекте генетических инструкций в клетках – показали новую генетическую подпись для беспорядка. Подпись помогает объяснить случаи, у которых нет других генетических маркеров аутизма.Результаты, сообщил 28 сентября 2017, в журнале Cell, предположите, что просмотр всего генома пациента мог помочь исследователям лучше понять номер люкс генетических аномалий, лежащих в основе аутизма. Если копируется, результаты могли бы в конечном счете помочь врачам диагностировать беспорядок, заявляет лидер исследования Эван Эйчлер, следователь Howard Hughes Medical Institute (HHMI) в Вашингтонском университете.
Целый упорядочивающий геном, техника, которая быстро становится более доступной и доступной, предоставляет полную генетическую информацию пациента. «В пять к 10 годам, целый упорядочивающий геном мог быть самым информативным инструментом для диагноза аутизма», говорит Эйчлер.Текущие генетические тесты на аутизм просматривают широкие части генома для вставок ДНК или удалений, которые были ранее связаны с аутизмом.
Другие тесты ищут изменения в стандартных блоках ДНК определенных генов. Но эти тесты флаг только приблизительно 10% к 30% случаев.
На основе семейных историй генетика играет роль примерно в 50% случаев аутизма.Чтобы искать другую наследственную изменчивость, которая могла бы быть уникальна для аутизма, Eichler и его коллеги хотели исследовать весь набор пациента генетической информации.Исследователи в нью-йоркском Центре Генома, включая бывшего директора центра, Следователя HHMI Роберта Дарнелла, упорядочили геномы 516 аутичных детей без семейной истории аутизма и никакие генетические аномалии, обнаруженные текущими тестами. Исследователи также упорядочили геномы детских родителей и незатронутого родного брата – 2 064 человека всего.
Генетическая информация содержится в Симплексной базе данных исследования Коллекции Simons.Eichler и коллеги проанализировали данные каждой семьи, ища наследственную изменчивость, которая произошла только в детях с аутизмом. «С таким количеством семей, чтобы учиться, усилие было крупным обязательством, которое потребовало двух миллионов часов компьютерной продолжительности обработки», говорит Тичел Тернер, постдокторант в лаборатории Эйчлера.
Команда провела приблизительно год, анализируя данные, говорит она.Команда Эйчлера определила генетические изменения, которые разрушили функцию гена и принудили к измененному производству белка и генетическим удалениям, слишком маленьким видеть с текущими тестами.
Исследователи также нашли изменения в областях генома, которые не содержат гены, но ответственны за включение генов. Eichler и коллеги отметили все изменения в базе данных Simons так, чтобы другие могли использовать результаты в качестве ресурса, говорит Тернер.
Тогда исследователи сравнили количество изменений в геномах аутичных детей с тем из их незатронутых родных братьев. У детей с аутизмом, значительно более вероятно, будет три или больше различных видов наследственной изменчивости, найденная команда.
Это предполагает, что комбинация спорадической наследственной изменчивости могла способствовать аутизму, говорит Эйчлер. Но он подчеркивает, что исследователи должны копировать эти результаты в большем количестве семей перед определенными генами, или генные комбинации используются для диагноза.Однако, идея, что многократная наследственная изменчивость могла привести к аутизму, означает, что исследователи «должны вырыть глубже даже на случаях, мы думаем, что уже решили», говорит Эйчлер.
Целый упорядочивающий геном мог показать дополнительную наследственную изменчивость в детях, уже диагностированных беспорядок.