Хотите знать, насколько связанный Вы вомбату? Или амеба?
Теперь Вы можете благодаря недавно выпущенному Открытому Дереву Жизни, пришивающей больше чем 500 родословных различных групп организмов для создания супердерева с 2,3 миллионами разновидностей.Исследователи уже начали помещать эти новые данные для работы к лучшему пониманию жизни на Земле. “Все, что мы изучаем в биологии, может быть прикреплено где-нибудь на дереве жизни”, говорит Джеймс Розинделл, вычислительный биолог в Имперском Колледже, Лондон, кто не был связан с базой данных. “Очень значительно, что ученые наконец произвели полное дерево”.
За прошлые 3 года приблизительно 35 человек из 11 американских лабораторий провели приблизительно 100 000 часов, обыскивая научную литературу для родословных. Они должны были решить вопросы обозначения — иногда, разновидность будет иметь многократные имена, и однажды ехидна разделила то же прозвище с угрем мурены, путая компьютеры. “Нет никакой единственной базы данных принятых имен, таким образом, группа должна была придумать один”, говорит соавтор Дуглас Солтис, эволюционный биолог в университете Флориды, Гейнсвилла.Он и его коллеги ожидали, что пришивание этих различных родословных — который часто не соглашался — будет твердой частью.
Но что озадачило их, большинство было недостатком оцифрованных данных. Из 7 500 деревьев, изданных между 2000 и 2012, было компьютеризировано только каждое шестое. В конечном счете бригада использовала приблизительно 500 меньших деревьев для строительства одного большого, говорит Карен Крэнстон, эволюционный биолог в Университете Дюка в Дареме, Северная Каролина, кто помог скоординировать усилие.
С этим размером относительно небольшой выборки дерево эскиза, выпущенное онлайн в этом месяце в Продолжениях Национальной академии наук, “, не суммирует то, что мы знаем”, говорит Крэнстон.Но веб-сайт дерева включает ссылки на оригинальные исследования, исследованные, которые открывают дополнительный вид, добавляет она.
Кроме того, место строится, чтобы принять обратную связь и включить новые данные, которые будут в конечном счете использоваться для обновления дерева. “Мы надеемся, что дерево выглядит очень отличающимся год с этого времени”, добавляет Кранстон.Между тем Розинделл и Янь Вон, эволюционный биолог в Оксфордском университете Музей естественной истории, адаптировали компьютерный инструмент, который они разрабатывали, чтобы помочь людям «видеть» дерево.
Названный OneZoom, проект работает как Google Maps, в котором пользователь может бурить землю магистрали дерева, отделения и наконечники для наблюдения еще более прекрасных деталей. В этом видео OneZoom начинается с обзором дерева, затем увеличивает масштаб последовательно более подробных отделений, приводящих сначала к животным, затем плацентарным млекопитающим отношения, и наконец людям.
Для этого дерева Вонг использовал не только Открытые данные о Дереве, но также и данные от других исследований, которые он идентифицировал как важный.“Это – одна холодная визуализация”, говорит Открытое Дерево Пожизненного координатора и эволюционного биолога Стивена Смита из Мичиганского университета, Анн-Арбор.
Он надеется, что будет еще много адаптации данных. Если Вы могли бы объединить его с другими данными, например, “Вы можете сделать свое собственное дерево жизни”.