У микробиологов есть новый способ сказать, чье дерьмо является dirtying воды. Обзор сточных вод по США показывает, что каждый город имеет отличный микробовый характер, который может показать признаки здоровья, такой как, как страдающий ожирением его жители склонны быть. Десятки микроорганизмов, идентифицированных в обзоре, распространены всюду по США и могли обеспечить лучшие способы сказать, прибывает ли бактериальное загрязнение от людей.
Человеческий пищеварительный тракт заполнен микроорганизмами, оказывающимися еще более важными для здоровья и болезни. Понять разнообразие этих бактерий — коллективно назвало микробиом пищеварительного тракта — и как их числа и типы варьируются в течение времени, микробиологи изолировали и упорядочили ДНК от образцов кала сотен людей. Но Митчелл Соджин, молекулярный эволюционист в Морской Биологической Лаборатории в Отверстии Древесины, Массачусетс, и Сандре Маклеллан, микробиологе в университете Висконсина, Милуоки, хотел получить намного более широкое представление и изучить микробиомы всех человеческих сообществ. Кроме того, они искали лучший индикатор человеческого фекального загрязнения.
Чтобы сделать это, они должны были выяснить, как оценить микробиомы больших количеств людей сразу. Они приняли на работу операторов станции очистки сточных вод из 71 США, цитирует для сбора больше чем 200 образцов коммунально-бытовых сточных вод, поступающих на очистную установку. Они тогда упорядочили ДНК в образцах и определили ее происхождение.
Приблизительно 15% изолированной ДНК сточных вод принадлежали микроорганизмам, найденным в людях, бригада Соджина и Маклеллана, о которой сообщают онлайн на прошлой неделе в mBio. Многие из остальных являются микроорганизмами, это живет в сточных трубах.
Используя метод, развитый Sogin и его коллегами, которые могут более точно определить, какие бактерии присутствуют в большой выборке экскрементов, исследователи идентифицировали приблизительно 60 типов бактерий, которые были характерны для людей во всех городах. Поскольку они, кажется, найдены везде, где люди, эти 60 могут быть более надежным способом определить, загрязняют ли человеческие экскременты водный путь, говорит Маклеллан.Но изобилие этих и менее обыкновенных бактерий, различных с места на место.
Эта разновидность в микробиомах «всего коллектора» отразила разновидность, замеченную среди обзоров микробиомов отдельных людей. Каждый город имел “уникальную подпись”, объясняет Маклеллан.
Те различия предлагают намеки о здоровье жителей городов. Толстые люди склонны иметь различный микробиом от того из минимизированных людей, например. Путем анализа микроорганизмов в сточных водах каждого города могли сказать исследователи, который имел проблему ожирения, говорит Соджин.
Денвер и Ки-Уэст, Флорида, микроорганизмы отразили более минимизированную популяцию, чем те от Солончака, Канзас, и Мемфиса, Теннесси, например. Исследователи не проверили, могут ли микробиомы сточных вод указать другие санитарные условия.“Что обращается ко мне [об этой работе], масштаб и новинка”, говорит Гэри Хуффнэйгл, микробиолог в Медицинском центре Мичиганского университета в Анн-Арборе, не связанный с работой. “Это имеет потенциал для открытия нового способа посмотреть на крупномасштабные популяции для эпидемиологических анализов”.
Несмотря на то, что анализ микробиомов популяции города в целом может затенить важные индивидуальные различия, он также показывает образцы, очевидные только в широком масштабе, отмечает Хуффнэйгл. Кроме того, намного легче собрать корму из коллекторов, чем путем сбора образцов кала от людей. “Мы можем фактически изучить людей без всех документов”.