Согласно исследованию, опубликованному в The Lancet, новый генетический анализ 10 последовательностей генома нового коронавируса (2019-nCoV) у девяти пациентов из Ухани показывает, что этот вирус наиболее тесно связан с двумя коронавирусами типа SARS, полученными от летучих мышей.
Авторы говорят, что, хотя их анализ предполагает, что летучие мыши могут быть первоначальным хозяином вируса, животное, продаваемое на рынке морепродуктов Хуанань в Ухане, может представлять собой промежуточного хозяина, который способствует появлению вируса у людей. По этой причине дальнейшая эволюция, адаптация и распространение этого вируса требует срочного расследования.
В исследовании авторы приводят эпидемиологические данные девяти пациентов, у которых была диагностирована вирусная пневмония неустановленной причины. Образцы клеток и секрета были взяты из легких пациентов для сбора образцов вируса 2019-nCoV, которые были проанализированы для определения происхождения вируса и того, как он проникает в клетки человека.
Восемь пациентов посетили рынок морепродуктов Хуанань. Один пациент никогда не посещал рынок, но до начала болезни останавливался в отеле рядом с рынком.
Авторы обнаружили 2019-nCoV во всех 10 генетических образцах, взятых у пациентов, включая восемь полных геномов и два частичных генома. Генетические последовательности образцов были почти идентичны (общее более 99.98% одной и той же генетической последовательности), что указывает на совсем недавнее появление вируса среди людей.
"Поразительно, что описанные здесь последовательности 2019-nCoV у разных пациентов были практически идентичны. Это открытие предполагает, что 2019-нКоВ возник из одного источника в течение очень короткого периода времени и был обнаружен относительно быстро. Однако по мере того, как вирус передается большему количеству людей, необходимо постоянное наблюдение за возникающими мутациями," говорит один из ведущих авторов профессор Вейфэн Ши, Ключевая лаборатория этиологии и эпидемиологии новых инфекционных заболеваний в университетах Шаньдуна, Первом медицинском университете Шаньдуна и Академии медицинских наук Шаньдуна, Китай.
Сравнивая генетическую последовательность 2019-nCoV с библиотекой вирусов, авторы обнаружили, что наиболее близкородственными вирусами были два SARS-подобных коронавируса происхождения летучих мышей – bat-SL-CoVZC45 и bat-SL-CoVZXC21, – которые имели 88% общего генетическая последовательность. 2019-nCoV был более генетически далек от вируса SARS человека (который имел около 79% генетической последовательности) и вируса ближневосточного респираторного синдрома (MERS) (который имел около 50% генетической последовательности).
Изучая спайковый белок вируса (как он связывается, а затем проникает в клетки человека), авторы обнаружили, что 2019-nCoV и вирус SARS человека имеют схожие структуры, несмотря на некоторые небольшие различия. В результате авторы предполагают, что 2019-nCoV может использовать тот же молекулярный дверной проем для проникновения в клетки, что и SARS (рецептор, называемый ACE2), но обратите внимание, что это потребует подтверждения.
Основываясь на своих данных, авторы говорят, что вполне вероятно, что 2019-nCoV, вызвавший вспышку в Ухане, может быть первоначально размещен летучими мышами и передаваться людям через неизвестное в настоящее время дикое животное, продаваемое на рынке морепродуктов Хуанани.
Они говорят, что более вероятно, что коронавирусы летучих мышей мутируют, чем 2019-nCoV, а это означает, что 2019-nCoV вряд ли возник из-за случайной мутации. Однако требуется больше информации, и если будет идентифицирован более близкий вирус животного происхождения, это предположение может быть неверным.
"Эти данные согласуются с резервуаром летучих мышей для коронавирусов в целом и 2019-nCoV в частности. Однако, несмотря на важность летучих мышей, вполне вероятно, что другое животное-хозяин выступает в качестве промежуточного хозяина между летучими мышами и людьми," говорит профессор Гуйчжэнь Ву, Китайский центр по контролю и профилактике заболеваний.
Объясняя это, она отмечает: "Во-первых, о вспышке впервые сообщили в конце декабря 2019 года, когда большинство видов летучих мышей в Ухане впадают в спячку. Во-вторых, летучие мыши не продавались и не находили на рынке морепродуктов Хуанани, в то время как многие неводные животные (включая млекопитающих) были. В-третьих, сходство генетических последовательностей между 2019-nCoV и его близкими родственниками bat-SL-CoVZC45 и bat-SL-CoVZXC21 составляло менее 90%, что означает, что эти два коронавируса, происходящие от летучей мыши, не являются прямыми предками 2019-nCoV. В-четвертых, как при SARS, так и при MERS, летучие мыши выступали в качестве естественного резервуара, при этом другое животное выступало в качестве промежуточного хозяина, а люди – в качестве конечных хозяев.Это еще раз подчеркивает скрытый резервуар вируса в диких животных и их способность распространяться среди людей."